Berdasarkan Surat Keputusan Direktur Politeknik Kelautan dan Perikanan Jembrana Nomor KEP.35/BRSDM-POLTEK.JBR/OT.210/I/2023 tentang Struktur Organisasi, Tata Kerja, dan Personalia Politeknik Kelautan dan Perikanan Jembrana Tahun Anggaran 2023, Unit Penunjang Politeknik Kelautan dan Perikanan Jembrana terdiri atas sembilan (9) unit kerja dan tiga (3) sub unit kerja yang terdiri atas :